Większość programów księgowych ma możliwość wygenerowania i wysłania pliku JPK do MF - skorzystanie z takiej opcji to chyba najwygodniejsze rozwiązanie. Program od wFirma ma taką funkcję, tu
https://wfirma.pl/jpk jest o niej trochę - warto go przetestować, zwłaszcza, że ma wiele innych przydatnych w prowadzeniu księgowości funkcji.